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猪日本乙型脑炎病毒荧光定量RT-PCR试剂盒
产品名称:猪日本乙型脑炎病毒荧光定量RT-PCR试剂盒
英文名称:Epidemic Encephalitis B SYBR qRT-PCR Kit
乙型脑炎病毒(Epidemic Encephalitis B)是一种 RNA 病毒,也是猪日本乙型脑炎(流行性乙型脑炎)的病原体,在低温条件下,该病毒能自下而上较长时间,在动物、鸡胚及组织培养细胞中均能增殖。幼猪是乙脑病毒的主要传染源和中间宿主,蚊子是乙脑 病毒的传播媒介。当人受带病毒的蚊子叮咬后,乙脑病毒进入人体,在血管内皮 细胞、淋巴结、肝、脾等吞噬细胞内增殖,并经血液循环到达脑部而引起炎症, 因此乙型脑炎病毒的快速准确鉴定对该病的预防和检疫有着重要作用。本产品基于 PCR 原理开发。它具有下列特点:
1. 一站式,用于不需要单独准备每种成分,包括引物和对照。
2. 根据乙型脑炎病毒的保守基因序列设计的引物,具有良好的特异性。
3. 基于染料法 qRT-PCR 检测,灵敏度比常规 RT-PCR 高 10-100 倍,可以达到至少 1000 拷贝/反应。
4. 使用一管式 qRT-PCR 技术,RT 和 PCR 两步在一个试管内完成,不需要中间转移样品,降低了操作误差和可能的污染。
5.本产品足够 50 次 30μL 体系的 RT-PCR,只能用于科研,不能用于临床。
【试剂组成】
成 份 | 包装 |
2×qRT-PCR 缓冲液 | 500 μL(棕色管) |
10×qRT-PCR 酶混合液 | 100 μL(红盖) |
ROX 染料 I,50× | 20 μL(棕色管) |
ROX 染料 II,50× | 20 μL(棕色管) |
荧光 PCR 专用模板稀释液 | 1mL(亮黄盖) |
乙型脑炎病毒 qRT-PCR 引物混合液 | 100 μL(白盖) |
乙型脑炎病毒 qRT-PCR 阳性对照 (1×10E8 拷贝/μL) | 50 μL(黄盖) |
核酸释放剂 | 1mL(绿盖) |
使用手册 | 1 份 |
【运输及保存】
低温运输,-20℃保存,保存期限为 12 个月。阳性对照需要因易污染其他成分需要单独放置。本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供 RNA 片段作为阳性对照
【自备试剂】样品 RNA
【注意事项】
一、稀释阳性对照(以 10E2-10E7 这 6 个 10 倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原。
1.标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
2.在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(本试剂盒提供),充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
3.换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
4.换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品 RNA 的制备
5.如果有 N 个样品,必须设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 上步制备的阳性对照梯度稀释液中的第 4 号(浓度为 1×10E4 拷贝/μL,10μL 相当于 1 万拷贝)再加上一定量的水作为制备的阳性对照(加水后其总体积跟样品一样,样品体积多少取决于所用试剂盒的要求)。可以用水作为制备的阴性对照。
6.用自选方法纯化 N+2 个样品的 RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒 RNA/提取试剂盒兼容。本试剂盒免费赠送1ml免 RNA 提取的核酸释放剂,其使用手册可以向本公司客服索取。
三、设置 RT-PCR 反应(20μL 体系,在样品制备室进行)
7.如果做定量分析并且只做 1 次重复,则标记 N+9 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照,6 个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1 次重复,则标记 N+4 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),1 个用于 PCR 阳性对照(用第 4 号阳性对照稀释液做模板)。下面只描述定量分析的步骤,定性分析只是把 6 个标曲反应缩减成 1 个,其余不变。
8.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,阳性对照样品要等所有管子盖上盖子后最后加):
成分 | N+2 个制备 所得样品 | RT-PCR 阴性对照 | RT-PCR 阳性 对照(2-7 管) |
2×qRT-PCR 缓冲液 | 10μL | 10μL | 各 10μL |
乙型脑炎病毒 qRT-PCR 引物混合物 | 2μL | 2μL | 各 2μL |
50×ROX (见注) | 0.4μL | 0.4μL | 各 0.4μL |
样品制备所得 RNA 模板 (来于第 8 步) | 5.6μL | 不加 | 不加 |
稀释所得 6 个阳性对照 (来于第 6 步) |
不加 |
不加 | 各 5.6μL(2 号样 到 2 号管,3 号样到 3 号管…) |
10×qRT-PCR 酶混合液 | 2μL | 2μL | 2μL |
注:需使用 ROX 染料 I 的机型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step-One、Step-One Plus。
需使用 ROX 染料 II 的机型::ABI Prism 7500、7500Fast、MJ Research 的 Chromo4、Opticon(II)Corbett Rotor Gene 3000。
不 需 要 使 用 ROX 的 机 型 : Thermal Cycle Dice Real Time System , LightCycler、Smart Cycler System、Agilent Mx3000P、RotorGene 3000、RotorGene 6000。
9. 上机后按下面参数进行 RT-PCR(参数可能会因仪器不同而需优化)。
过程 | 温度 | 时间 |
RT(逆转录) | 50℃ | 2min |
预变性 | 95℃ | 10min |
RT - PCR 反应 (40 个循环) | 95℃ | 15 sec |
60℃ | 1 min(采集 FAM 通道的荧光信号) | |
按仪器预设程序进行熔解曲线分析 |
四、数据处理
10.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 RNA 浓度的 log 值,再推算出其浓度。
如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等于 40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性,如果小于或等于 35 则为阳性。如果在 35-40 之间,则重复一次。