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鼠疫耶尔森菌探针法荧光定量PCR试剂盒
产品名称:鼠疫耶尔森菌探针法荧光定量PCR试剂盒
英文名称:YersiniapestisProbe qPCR Kit
鼠疫耶尔森菌也叫做鼠疫杆菌(Yersiniapestis)是鼠疫的病原菌,鼠疫是一种人兽共患的自然疫源性烈性传染病,人类鼠疫多为疫鼠的跳蚤叮咬而感染, 是我国法定的甲类传染病。此菌引起的是啮齿动物中的自然疫源性疾病,传染性强,病死率高,易酿成大流行,此菌主要累及皮肤和淋巴结,其次为败血症、肺炎、脑膜炎,对人体健康有较大危害,因此快速检测鼠疫耶尔森菌(鼠疫杆菌)具 有重要意义。本产品就是以探针法荧光定量 PCR 技术为基础开发的专门检测鼠疫耶尔森菌(鼠疫杆菌)的试剂盒,它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供样品 DNA 模板。
2. 引物和探针经过优化,灵敏性高。
3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4. 特异性高,引物是根据鼠疫耶尔森菌(鼠疫杆菌)高度保守区设计,不会跟其 他病原 DNA 发生交叉反应。
5. 本产品足够 50 次 20μL 体系的探针法荧光定量 PCR 反应。
6. 本产品只能用于科研。
【试剂组成】
成分 | 包装 |
2×Probe qPCR MagicMix | 500 μL(本色盖) |
荧光PCR 专用模板稀释液 | 1 mL(黄盖) |
鼠疫耶尔森菌探针法qPCR 引物混合液 | 100 μL(白盖) |
鼠疫耶尔森菌 qPCR 探针 | 50 μL(棕色管) |
鼠疫耶尔森菌探针法qPCR 阳性对照(1*10EB拷贝/ul) | 50 μL(黄盖) |
使用手册 | 1 份 |
【运输及保存】
低温运输,-20℃保存,保存期限为 12 个月。
【自备试剂】样品 DNA。
【注意事项】
一、稀释标准曲线样品(以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原, 本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的 DNA 片段作为阳性对照。
1. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
2. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
3. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震
荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品 DNA 的制备
7. 如果有 N 个样品,最好设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性
对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 阳性对照的 10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为 NC。
8. 用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数 DNA/提取试剂盒兼容。
三、Probe qPCR 反应(20μL 体系,在样品制备室进行)
9. 如果做定量分析并且只做 1 次重复,则标记 N+9 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),6 个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1 次重复,则标记 N+4 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),1 个用于 PCR 阳性对照(用第 4 号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设 置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好
后最后加):
成分 | 样品管 N+2 个 | PCR 阴 性对照管 | 标准曲线 样品管(2-7 管) |
2×Probe qPCR MagicMix | 10 μL | 10 μL | 各 10 μL |
鼠疫耶尔森菌 qPCR 探针 | 1 μL | 1 μL | 各 1 μL |
鼠疫耶尔森菌探针法 qPCR 引物 混合液 | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
N+2 个待测 DNA 模板 | 7 μL | - | - |
超纯水 | - | 7 μL | - |
第 7 步所得标准曲线样品稀释液 (2-7 号) |
- |
- | 各 7 μL(2 号样到 2 号管,3 号样到 3 号管…) |
11. 盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR:
过程 | 温度 | 时间 |
预变性 | 95℃ | 3 min |
PCR 反应 (40 个循环) | 95℃ | 15sec |
60℃ | 1 min(采集 FAM 通道的荧光 信号) |
四、数据处理
12. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品RNA 浓度的 log 值,再推算出其浓度。
13. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等于 40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性,如果小于或等于 35 则为阳性。如果在 35-40 之间,则重复一次。若重复结果 Ct 值
小于 40,扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性,否则为阴性。