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人免疫缺陷病毒I型通用探针法RT-PCR试剂盒
产品名称:人免疫缺陷病毒I型通用探针法RT-PCR试剂盒
英文名称:Human Immunodeficiency Virus 1(HIV-1) RT-PCR Kit
人类免疫缺陷病毒(Human Immunodeficiency Virus;abbr:HIV),即艾滋病(AIDS,获得性免疫缺陷综合征)病毒,是造成人类免疫系统缺陷的一种病毒。1981年,人类免疫缺陷病毒在美国首ci发现。它是一种感染人类免疫系统细胞的慢病毒,属逆转录病毒的一种。目前全球流行的主要是 HIV-1。本产 品就是以探针法荧光定量 RT-PCR 技术为基础开发的专门检测人免疫缺陷病毒 I 型通用的试剂盒,它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供样品RNA模板。
2. 引物和探针经过优化,分析灵敏性高。
3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4. 特异性高,引物是根据人免疫缺陷病毒I型RNA高度保守区设计,可以检测人免疫缺陷病毒I型,不会跟其他病毒的RNA发生交叉反应。
5. 既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量级。
6. 本产品足够50次20μL体系的探针法荧光定量RT-PCR反应。
7. 本产品只能用于科研。
【试剂组成】
成分 | 包装 |
探针法qRT-PCR缓冲液 | 500μL(蓝盖) |
探针法qRT-PCR酶混合液 | 100μL(红盖) |
荧光PCR专用模板稀释液 | 1mL(绿盖) |
人免疫缺陷病毒I型qRT-PCR 引物-探针混合液 | 150μL(棕色管) |
人免疫缺陷病毒I型RT-PCR阳性对照(1×10E7拷贝/μL) | 50μL(黄盖) |
使用手册 | 1份 |
【运输及保存】低温运输,-20℃保存,保存期限为 12 个月。
【自备试剂】超纯水,样品RNA。
【注意事项】
一、稀释标准曲线样品(以10E1-10E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
1. 标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。
2. 用带芯枪头分别加入45μL荧光RT-PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
3. 在6号管中加入5μL 1×10E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×10E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头,在5号管中加入5μL 1×10E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在4号管中加入5μL 1×10E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品RNA的制备
7. 如果有N个样品,最好设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10μL上步所得4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为NC。
8. 用自选方法纯化样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数RNA/提取试剂盒兼容。
三、Probe qRT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
9. 如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复,则标记N+4个RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),1个用于RT-PCR阳性对照(直接用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
成分 | 样品管 N+2个 | RT-PCR阴性对照 | 标准曲线样品管 (1-6管) |
探针法qRT-PCR缓冲液 | 各10μL | 10μL | 各10μL |
探针法qRT-PCR酶混合液 | 各2μL | 2μL | 各2μL |
人免疫缺陷病毒I型RT-PCR 引物-探针混合液 | 各3μL | 3μL | 各3μL |
N+2个待测RNA样本 | 各5μL | 不加 | 不加 |
超纯水 | 不加 | 5μL | 不加 |
第6步所得标准曲线样品稀释液(1-6号) | 不加 | 不加 | 各5μL(1号样到1号管,2号样到2号管…) |
11. 盖上盖子后上机,按下面参数进行RT-PCR:
过程 | 温度 | 时间 |
逆转录 | 50℃ | 30min |
预变性 | 94℃ | 5min |
RT-PCR反应 (45个循环) | 94℃ | 15sec |
60℃ | 1min(采集FAM通道的荧光信号) |
五、数据处理
12. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再推算出其浓度。
13. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于45。阳性对照必须有荧
光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于40。对待测样品,如果其Ct大于或等于45则为阴性,如果小于或等于40则为阳性。如果在40-45之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于45则为阴性,如果小于40,则为阳性。